بهینه سازی الگوی ژل الکتروفورز دو بعدی مایع زلالیه چشم قربانیان بمباران شیمیایی ایران

پایان نامه
چکیده

بالغ بر سی هزار مجروح شیمیایی از جنگ تحمیلی هشت ساله به جای مانده است. گاز خردل از جمله گازهای شیمیایی تاول زاست که بارها توسط رژیم بعث عراق علیه رزمندگان ایرانی و مردم بی دفاع ایران و عراق مورد استفاده قرار گرفت. یکی از ضایعات دیررس گاز خردل بر روی چشم قربانیان، آسیب های ساختاری قرنیه و اختلالات اشکـی می باشد. رگ زایی در قرنیه از مهمترین عوامل تخریب قرنیه این دسته از قربانیان است.مایع زلالیه به واسطه برخی پروتئین های خود نقش مهمی در مهار رگ زایی در قرنیه ایفا می کند. در این کار فرض بر این بود که منشأ رگ زایی در قرنیه قربانیان شیمیایی با عملکرد و محتوای پروتئوم مایع زلالیه مرتبط باشد. برای آزمودن این فرضیه نیاز به انجام پروتئومیکـس مقایسه ای بین گروه قربانیان شیمیایی و گروه شاهد می باشد. یکی از مهمترین چالش ها در پروتئومیکس بر پایه ژل دو بعدی، بدست آوردن یک ژل با کیفیت بالا می باشد. در این مطالعه ابتدا روش های بدون رسوب گیری آزموده شدند، در نهایت از بین روشهای رسوب گیری مختلف، رسوب گیری با استون به منظور رسیدن به ژلی با بیشترین لکه های پروتئین و کمترین پس زمینه انتخاب گردید. مقادیر و ترکیبات موجود در بافرهای باز محلول سازی و بازآبدهی نیز بهینه شدند. با اعمال شرایط بهینه در نهایت ژلی با کیفیت قابل قبول برای آنالیز مقایسه ای بعدی پروتئوم مایع زلالیه قربانیان و گروه شاهد به هدف شناسایی پروتئین های دخیل در بروز عوارض دیررس چشمی بدست آمد.

منابع مشابه

بهینه سازی الگوی الکتروفورز دو بعدی پروتئین های اپی-تلیوم قرنیه به منظور دستیابی به نشانگرهای پروتئینی دخیل در بروز عوارض دیررس در چشم قربانیان شیمیایی ایران

در این کار، فرض بر این بود که گاز خردل سبب بروز تغییراتی در پروتئوم سلول های اپی تلیوم قرنیه چشم جانبازان شیمیایی می شود که پس از گذشت یک دوره نهفته سبب بروز عوارض دیررس در چشم این افراد می شود. از این رو بررسی پروتئوم مقایسه ای سلول های اپی تلیوم قرنیه ی چشم جانبازان شیمیایی با افراد سالم به منظور یافتن تغییرات احتمالی در پروتئوم سلول های اپی تلیوم قرنیه چشم انجام شد. بدین منظور دو روش برای آم...

15 صفحه اول

ارزیابی نشانگرهای پروتئینی دخیل در بروز عوارض دیررس در چشم قربانیان بمباران شیمیایی ایران

در طول سال های جنگ تحمیلی (1980-1988)، عوامل شیمیایی به کررات از طرف رژیم بعث، علیه نظامیان و مناطق مسکونی به کار گرفته شد و صدمات جبران ناپذیر و وخیمی را در اندام های خارجی همچون ریه، چشم و پوست قربانیان برجای گذاشت. متأسفانه به دلیل پیچیدگی عوارض ایجاد شده و سختی تهی? نمونه از مصدومان شیمیایی، هیچ گونه توصیف جامع و کاملی از مکانیسم های مولکولی و پاتوفیزیولوژی این مصدومیت ها در دست نیست. گزارش...

15 صفحه اول

تطبیق لکه‌های پروتئینی در تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی بر پایه مدل‌های احتمالاتی

تطبیق لکه‌های پروتئینی در تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی (2DGE) یکی از فرآیندهای اصلی در تحلیل این تصاویر است. به‌دلیل چالش‌های موجود در تصاویر 2DGE همچون حضور نویز و آرتیفکت‌، تطبیق لکه‌های پروتئینی تحت نظارت کاربران انجام می‌گیرد که این نظارت موجب ایجاد خطای انسانی می‌گردد. ازاین‌رو در این تحقیق، الگوریتمی جدید و خودکار برای تطبیق لکه‌های پروتئینی، مبتنی بر مدل‌های احتمالاتی ارایه شده است. به‌د...

متن کامل

توسعه‌ی فیلتری جدید برای استخراج لکّه‌های پروتیینی در تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی

الکتروفورز ژل دو بعدی یکی­از روش‌های پایه و پرکاربرد در علم پروتئومیک است. درین روش، پروتیین‌های موجود در نمونه­ی اوّلیه براساس دو ویژگی وزن مولکولی و بار الکتریکی در دو بعد ازهم جدا شده و تصویری از لکّه­های پروتیینی می­دهد. به دلیل تعداد زیاد لکّه‌های پروتیینی موجود دریک ژل نمونه که نزدیک به هم قرار دارند، پردازش تصاویر فرآیندی پیچیده است. وجود منابع نویز و آرتیفکت هم­چون شکستگی‌ها، آرتیفکت‌های ن...

متن کامل

آنالیز داده های ژل های الکتروفورز دو بعدی با استفاده از روش های آماری چند متغیره

سابقه و هدف : در سـال های اخیـر تکنولـوژی مـربوط به تـوصــیف لکه های پروتئینی نمایان شده بر ژل های الکتروفورز دو بعدی، توسعه ی قابل ملاحظه ای یافته و نرم افزارهای متعدد آماری آنالیز ژل نیز ایجاد و گسترش یافته است که تأثیر این ابتکارات بر ارتقاء پروتئومیک بسیار چشمگیر است.آنالیز داده های عظیم پروتئومیکی با دارا بودن متغیر های زیاد نیاز به روش های چند متغیره است که امکان آنالیز آماری همزمان چندین...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده زیست شناسی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023